鄯善县位于新疆北部，属于温带大陆性气候区。夏季气温较高，平均温度为25℃左右，最高温度可达40℃以上。秋季气温逐渐下降，平均温度为15℃左右。冬季气温非常寒冷，平均温度为-15℃左右，最低温度可达-30℃以上。春季气温逐渐回升，平均温度为10℃左右。四季温差较大，昼夜温差也较大。同时，由于受到大陆性气候的影响，鄯善县年降水量较少，主要集中在夏季。