风化菩提根和菩提根的主要区别在于它们的形成过程和外观。菩提根是一种植物的种子，通常呈白色或淡黄色，表面光滑。而风化菩提根则是指菩提根在自然环境中经过长时间的风化和氧化，表面变得粗糙，呈现出深褐色或黑色的外观，有时还会有裂纹和孔洞。

风化菩提根因为经过自然处理，具有更加独特的质感和纹理，因此在文玩界备受追捧。