农村到部门办理慢性疾病流程如下；

1、初审申报：参保单位或参保个人首次申请须在每季度最后一个月15日以前，选定一家定点医院和一家特殊病种门诊服务药店就医、购药；

2、医院初审：初审医院收齐申请人的相应资料后，组织本院医疗专家诊查并初步鉴定；

3、专家评审：市医疗保险处每季季末组织本市城镇职工基本医疗保险专家委员会进行集中评审。

4、发放《特殊病种门诊专用病历》。