箱变中的电容器主要作用是补偿线路的电容和提高系统的功率因数。当箱变输出电流变化时，电容器能够快速响应并释放或吸收一定的电能，从而平衡线路的电压和电流，并提高系统的功率因数，减少潜在的损耗和电费成本。

此外，电容器还可以降低系统的谐波污染，保护设备免受电力干扰的影响。