车辆登记证的使用性质填写应根据实际情况进行选择，主要分为非营运和营运两种。非营运适用于个人私人使用或企事业单位内部使用，如家用轿车、私人越野车、企事业单位内部使用的货车、客车等。

营运适用于运输公司或个体经营者从事货物或人员运输等商业活动，如出租车、货运车、旅游车、校车等。在填写车辆登记证使用性质时，应根据车辆实际使用情况填写，填写错误可能会影响车辆的使用和行驶，甚至会导致处罚。