自主申报营业执照和非自主申报营业执照的区别在于申请人主动与被动的差异。

自主申报营业执照是指企业主动向相关行政机关提交申请材料，主动开展申请手续，并按照相关规定经过一系列审批程序后取得营业执照。在这种情况下，企业需要自行办理申请、提供相关资料，甚至可能需要进行现场检查。自主申报的优势在于可以灵活掌握申请进度，便于企业根据自身需求进行调整和安排。

非自主申报营业执照是指企业在特定情况下被相关行政机关要求提供相关材料进行申请，比如在政府主导的发展计划中，企业需要按要求办理营业执照。在这种情况下，企业的申请行为是被动的，需要按照相关要求提供材料，并经过相关机关的审批程序后才能取得营业执照。这种方式的办理比较受限制，申请人相对较少掌握申请进度和流程。

总之，自主申报营业执照与非自主申报营业执照的区别在于申请人主动与被动的差异，申请人可以根据需求选择适合自身情况的申请方式。