麝香龟高度水栖，适宜生长温度为21~26℃，通常栖息在大型的泉涧、溪流、沼泽以及灰岩坑所形成的池塘中，尤其喜欢栖息于流速较慢、底部松软、环境较为安静的水体中。并且麝香龟常活动于水底。