甲霜恶霉灵和噻呋酰胺都是高效的内吸性杀菌剂，具有广谱的杀菌效果，可以防治多种土壤病害。但是，它们的作用机制和防治对象略有不同。

甲霜恶霉灵主要通过抑制病原菌的蛋白质合成来杀死或抑制病原菌的生长，对于土壤传播的真菌性病害，如猝倒病、立枯病、枯萎病、黄萎病等都有很好的防治效果。同时，甲霜恶霉灵还能促进植物生长，提高植物抗逆能力，提高产量和品质。

噻呋酰胺是一种具有内吸和传导性能的杀菌剂，主要通过抑制病原菌的呼吸作用来杀死或抑制病原菌的生长，对于稻曲病、稻瘟病、纹枯病、黑穗病等多种病害有很好的防治效果。

因此，甲霜恶霉灵和噻呋酰胺哪个效果好，主要取决于防治的病害类型和作物种类。如果需要防治多种病害，建议复配使用这两种药剂，以提高防治效果。