昆明航空在长水机场没有单独的区域，其航班分散在长水机场的各个区域。长水机场的主航楼共有三层，一层为到达层，二层为出发层，三层为候机厅。昆明航空的航班根据其目的地的远近和机型大小，分别停靠在不同的候机楼和停机位。因此，昆明航空在长水机场没有固定的区域，乘客需要根据航班信息前往相应的候机楼和停机位办理登机手续。