过关包括两步，一是出境，即离开内地；二是入境，即进入香港。

高铁驶入西九龙站后，旅客在B4月台层下车，乘电梯到B2层入境层，办理内地出境程序。出境手续之后，直接往前走，离开内地口岸区，进入同一层的香港口岸区办理香港入境程序。之后再验票出匣，离开车站。