港澳通行证签注两个月一次，是指每次入境港澳时，持证人可以停留不超过两个月。签注的有效期是从签发之日开始计算。例如，签注于2022年1月1日签发，那么每次入境港澳的停留期限是2022年1月1日起计算的连续两个月。如果持证人在签注有效期内未入境港澳，则签注无效，需要重新申请签注。