病理切片的染色流程如下：
脱蜡：石蜡切片经二甲苯Ⅰ、Ⅱ脱蜡各5分钟，然后放入100%、95%、90%、80%、70%各级酒精溶液中各3~5分钟。
复水：放入蒸馏水中3分钟。
染色：将切片放入苏木精中染色约10~30分钟。染色时间应根据染色剂的成熟程度及室温高低，适当缩短或延长。室温高时促进染色，染色时间可短些，否则可适当延长时间，冬季室温低时可放入恒温箱中染色。
水洗：用自来水流水冲洗约15分钟，使切片颜色变蓝（或放入碱性水中也可）。但要注意流水不能过大，以防切片脱落。
分化：将切片放入1%盐酸乙醇液中褪色，约2秒至数十秒钟，见切片变红，颜色较浅即可。