神奇宝贝种族歧视的原因有如下几方面：

1、种族歧视由反动统治阶级采取立法、行政和其他措施，鼓吹和散布种族优越和种族仇恨学说等造成的。

2、种族歧视在古代即已存在，种族歧视始于古罗马帝国时代的自感优越主义者。

3、种族歧视现代形式是从资本原始积累时期开始的, 其现代形式是从资本主义原始积累时期开始的，主要包括剥夺选举权、受教育权和其他权利，压低工资，任意逮捕、拷打甚至杀害，强行限制在“保留地”内居住等。迄今为止，还有许多资本主义国家普遍存在种族歧视现象。