存单丢失三年后，一般情况下是无法申请挂失的。根据《中华人民共和国票据法》规定，持票人在票据到期前3年内，应当妥善保管票据，如存单丢失或遗失，应及时向银行或发行人申请挂失。超过3年未申请挂失的，持票人将难以成功挂失。

如果存单确实是丢失了，尽管已经超过了3年，仍然可以向发行人、管理人或银行提出申请。

但是，申请挂失的难度会相对较大，通常需要提供更多的证明文件和证据，而且挂失的成功率也不太高。