港澳通行证签注可以异地办理。异地办理需要提供本人有效的身份证明，就业人员需提供一年及以上有效的居住证、社保证明，高等院校在读的学生需提供加盖学校公章的证明及学生证，就可以异地办理签注。

2018年9月1日起，内地居民可在全国范围内任一公安出入境管理机构异地申请换（补）发普通护照、往来港澳通行证、往来台湾通行证；可在全国范围内任一公安出入境管理机构异地申请往来港澳台团队旅游签注。

2019年4月1日起，中华人民共和国往来港澳通行证，实行“全国通办”。申请人异地申办赴港澳台团队旅游签注，还可在自助签注机上办理，立等可取。从2019年7月1日起，往来港澳通行证收费标准由80元/张降为60元/张。