责令限期拆除的法律依据主要包括《行政处罚法》、《城市管理行政执法法》、《城市房屋拆迁管理条例》等。根据这些法律，当发现违法建筑、违规扩建或危险建筑等情况时，相关行政部门有权责令当事人限期拆除，以维护城市管理秩序和公共安全。