长鳍鱲和宽鳍鱲区别有科属区别；嘴巴区别；颜色区别；鱼鳍区别；斑点形状区别；别称区别。

科属区别：宽鳍鱲和长鳍鱲都是鲤形目和鲤科，但二者的属却是不同的。前者是鱲属的，后者则是马口鱲属的。

嘴巴区别：宽鳍鱲和长鳍鱲的嘴巴有差异。宽鳍鱲的嘴巴是向上倾斜的，而长鳍鱲的嘴巴则是向下倾斜的，仔细观察的话区别还是比较明显的，是二者重要的外观区别特征之一。

颜色区别：宽鳍鱲和长鳍鱲整体来看颜色都比较鲜艳，但二者具体的颜色有差异。宽鳍鱲的颜色以蓝色为主，长鳍鱲的颜色则以粉色和蓝色为主。

鱼鳍区别：二者的鱼鳍也有差异。比如它们胸鳍的长度就是不同的，宽鳍鱲的胸鳍比较短，长鳍鱲的胸鳍则比较长，这也是它得名的重要原因。

斑点形状区别：二者身体上都有斑点或者斑块，不过形状是不同的。宽鳍鱲的斑纹形状是面积比较大的斑块，而长鳍鱲的斑纹是条纹形状的。

别称区别：作为不同的两种鱼，宽鳍鱲和长鳍鱲有不同的别称。前者别称有“红翅子”、“双尾鱼”等，后者的有“长鳍马口鱲”、“溪哥”等。