股权转让份额填写的应该是实际拥有的股份数量，而不是对应的股票市值。因此，如果股东拥有50股股份，则填写50股。如果填写的是50万股，则会导致填写错误，可能引发交易风险和纠纷。因此，在填写股权转让份额时，需要仔细核对实际持股数量，以确保交易的顺利进行。