海拉尔站归哈尔滨铁路局管辖的原因主要有以下几个方面：

首先，海拉尔站位于中国内蒙古自治区呼伦贝尔市境内，是中国铁路哈尔滨局集团有限公司管辖的客货运一等站。

其次，海拉尔铁路分局曾是哈尔滨铁路局下辖的一个分局，其机关位于内蒙古自治区呼伦贝尔市海拉尔区。虽然2005年铁路局撤编铁路分局后改为哈尔滨铁路局驻海拉尔办事处，2011年又撤销了海拉尔办事处机构，但这些变更并没有改变海拉尔站归哈尔滨铁路局管辖的事实。

因此，基于以上原因，海拉尔站归哈尔滨铁路局管辖。