公积金还贷扣款未足额补缴有四种方法：

申请再次扣款。在扣款日未过的情况下，向扣款银行卡中转入充足的还款金额，并拨打公积金贷款机构电话申请重新扣款。

及时补充公积金。发现余额不足，及时向公积金账户中存入足够的资金。

与贷款银行/公积金管理中心协商。如果暂时无法补足余额，可与贷款银行或公积金管理中心沟通，说明情况并寻求解决办法。

调整还款计划。如果余额不足的情况持续存在，可以考虑调整还款计划，例如与贷款银行协商，延长贷款期限或调整每期还款额。