A分子中有两个高能磷酸键，分别连接着三个磷酸分子。高能磷酸键是一种特殊的化学键，在分子中储存着大量的能量。当这些键被水解时，能够释放出大量的热能，这使它们在生物体内广泛应用于细胞内能量储备和输送。

在A分子中，两个高能磷酸键的能量储存在分子中间的两个磷酸分子之间，当需要能量时，它们可以被特定的酶催化，释放出储存的能量。因此，高能磷酸键是生物分子中重要的能量储备方式之一。