在开店过程中，通常会有以下几个部门进行检查：

1. 城市规划部门：这个部门负责检查店铺是否符合相关建筑规划和区域规划的要求，包括建筑物的外观、大小、布局等。

2. 消防部门：消防部门会检查店铺的消防设施是否符合要求，如火警报警器、灭火器等，以确保店铺的消防安全。

3. 卫生监督部门：卫生监督部门会检查店铺的卫生状况，包括食品安全、卫生设施、垃圾处理等，以确保店铺的卫生环境合格。

4. 商事登记部门：商事登记部门负责核实商店的合法经营资格，包括营业执照、工商注册、税务登记等。

5. 环保部门：环保部门会检查店铺是否符合环保要求，如有无环境污染、噪音过大等问题。

此外，根据不同地区和行业的规定，还可能有其他部门进行检查，例如文化市场部门、商标局等。开店前应事先了解当地的相关规定和手续，确保符合各个部门的要求，避免因不合规而受到处罚。