1、定义不同；2、代表意义不同；3、编号不同。毕业证书，亦称“文凭”，是毕业生所取得的一种学历凭证。它表明持证者在某一级学校系统地学习过一定的`科学文化知识，是选拔干部和评定职务的重要依据。

1、定义不同

蓝本是学位证，是为了证明学生专业知识和技术水平而授予的证书，在我国学位证授予资格单位为通过教育部认可的高等院校或科学研究机构。

红本是毕业证，是学生通过系统的学习，修完学校所安排的全部课程并成绩合格，达到毕业条件，由办学单位颁发的用于证明学习经历的书面凭证。

2、代表意义不同

蓝本代表所学知识达到一定水平的认可，承认具备了一定水平的能力。学位代表着学习水平和层次。

红本代表在学制规定的年限内通过学习，修完教学计划所安排的全部课程并成绩合格，准予毕业。学历代表着学习的经历，仅仅证明了一个人学习的时间和过程。

3、编号不同

蓝本是各个学校自己授权发放的，编号不是全国统一的，且证书上没有网址，只是学位证的号码含义基本一样。

红本是全国统一编号，毕业证是学位证的基础。拿到毕业证才有资格申请学位证，在证书上有查询网址。