主要区别在于以下几个方面:

1.主体不同:公司工伤认定是由公司作为用人单位进行的，而员工工伤认定则是由劳动行政部门作为政府机构进行的。

2.程序不同:公司工伤认定的程序通常比员工工伤认定更为繁琐。公司需要提交一系列文件和申请材料，并经过劳动行政部门审核批准后，才能进行相应的工伤保险待遇。而员工工伤认定的程序相对简单，只需要提交受伤证明和医疗诊断证明等文件即可。

3.标准不同:公司工伤认定的标准通常比员工工伤认定的标准更为严格。公司需要提供充分的证据证明员工是在工作期间内因工作原因受到的伤害，才能认定为工伤。而员工