两轮电瓶车在跑长途时，与右边线的距离应该根据具体的路况和交通规则来确定。一般来说，为了保证安全和遵守交通规则，建议保持以下距离：

在普通道路上：尽量保持车辆与右边线约30~50公分的距离。这个距离可以让你在需要变道或者避让其他车辆时有足够的空间。

在高速公路上：由于高速公路的车速较快，建议保持车辆与右边线约1~1.5米的距离。这样可以确保你的车辆在行驶过程中更加稳定，并减少被其他车辆干扰的可能性。

需要注意的是，以上距离仅作为参考，实际距离应根据具体路况和交通规则进行调整。在行驶过程中，要时刻保持警觉，注意观察路况和周围环境，确保行车安全。同时，也要遵守交通规则，避免超速、逆行等危险行为。