GCT-11型探伤仪的深度设置可以通过操作面板上的深度调节按钮进行调整。首先，将探头放置在待检测的深度处，然后通过面板上的深度调节按钮，将深度值进行调整，直到探头能够精确捕捉到目标信号。

在进行深度设置时，需要根据实际情况进行调整，确保能够准确探测到目标，同时避免误判和漏检的情况发生。