1. 形态特征不同：直孔贝的外壳是红褐色的，有平滑的外形，贝壳呈锥形，而港湾贝的外壳是绿色的，有褶皱的外形，贝壳呈圆形。

2.生活习性不同：直孔贝属于浅滩贝类，一般生活在浅海和滩涂中，喜欢沙滩和砂石底。而港湾贝属于深海贝类，一般生活在深海洋和港湾，喜欢沉积物类底质。