有区别，区别在于，小蝌蚪点读笔A3和A6S的主要区别如下：

功能：A3s被俗称为性价比最高的点读笔，而A6s则多了几个测试功能和调速功能。尽管A6s的功能相对更多，但两款笔在其他大部分功能上是相同的。

性能参数：A3s相较于其他几款小蝌蚪笔，其性能参数有不同程度的升级，使得使用更为灵敏。

价格：A3s和A6s的价格相差几十元，具体价格取决于笔的功能和性能。

综上，A3s和A6s的主要区别在于功能、性能参数和价格。对于预算有限且不需要额外测试功能和调速功能的用户，A3s是一个不错的选择。而对于追求更多功能和更高性能的用户，A6s可能更适合。在购买时，建议根据个人需求和预算进行选择。