办理120平三层楼的房产证大概需要 5 万元左右。

因为在办理房产证时，需要支付土地使用费、核定费、证书工本费等多项费用，另外还需要交纳房产税和契税。

在不同地区，具体的费用标准可能会有所不同。

同时，需要注意的是，如若房屋产权证书和土地使用权证书不分别办理，还需要支付一个合并办理费用。

因此，在办理房产证过程中，需要咨询相关部门的规定及要求，以便更准确地了解费用情况。